Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pde4dQ01063 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde4dQ01063 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde4dQ01063 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde4dQ01063 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde4dQ01063 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde4dQ01063 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde4dQ01063 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms