Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb2Q00977 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb2Q00977 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms