Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stx2Q00262 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms