Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhodP97348 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhodP97348 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhodP97348 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RhodP97348 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhodP97348 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhodP97348 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms