Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RptnP97347 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RptnP97347 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RptnP97347 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RptnP97347 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RptnP97347 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RptnP97347 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RptnP97347 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RptnP97347 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RptnP97347 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RptnP97347 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RptnP97347 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RptnP97347 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RptnP97347 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RptnP97347 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RptnP97347 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RptnP97347 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RptnP97347 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RptnP97347 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RptnP97347 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RptnP97347 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RptnP97347 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RptnP97347 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RptnP97347 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms