Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vgll3P85442 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms