Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx1P83917 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms