Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irx3P81067 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Irx3P81067 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx3P81067 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms