Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd13P70217 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms