Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms