Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Traf5P70191 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf5P70191 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf5P70191 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf5P70191 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf5P70191 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms