Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SbdsP70122 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SbdsP70122 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms