Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vamp3P63024 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vamp3P63024 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms