Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps28P62858 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rps28P62858 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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