Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsnl1P62761 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsnl1P62761 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms