Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta2P62737 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta2P62737 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta2P62737 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Acta2P62737 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta2P62737 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta2P62737 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta2P62737 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms