Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Rps29P62274 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Rps29P62274 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Rps29P62274 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Rps29P62274 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
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Rps29P62274 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
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Rps29P62274 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rps29P62274 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
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Rps29P62274 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rps29P62274 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps29P62274 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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