Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms