Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme3P61290 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme3P61290 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme3P61290 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psme3P61290 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Psme3P61290 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme3P61290 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms