Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Siah1aP61092 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1aP61092 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms