Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia3P60469 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia3P60469 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms