Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P58686 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P58686 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P58686 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P58686 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P58686 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P58686 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P58686 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P58686 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P58686 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P58686 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P58686 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P58686 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P58686 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P58686 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P58686 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P58686 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms