Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl4P58321 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl4P58321 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms