Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace1P56818 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace1P56818 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace1P56818 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace1P56818 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace1P56818 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms