Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcd5P56812 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms