Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms