Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab8aP55258 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab8aP55258 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms