Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd3P55096 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd3P55096 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms