Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms