Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApodP51910 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ApodP51910 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApodP51910 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApodP51910 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApodP51910 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApodP51910 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApodP51910 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApodP51910 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApodP51910 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApodP51910 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApodP51910 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApodP51910 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApodP51910 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ApodP51910 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ApodP51910 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApodP51910 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApodP51910 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApodP51910 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApodP51910 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApodP51910 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApodP51910 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApodP51910 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApodP51910 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApodP51910 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ApodP51910 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApodP51910 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApodP51910 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ApodP51910 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApodP51910 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApodP51910 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApodP51910 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms