Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LumP51885 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LumP51885 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
LumP51885 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LumP51885 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LumP51885 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LumP51885 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms