Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa8P50706 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa8P50706 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa8P50706 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms