Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TspoP50637 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TspoP50637 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TspoP50637 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TspoP50637 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms