Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VdrP48281 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VdrP48281 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VdrP48281 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VdrP48281 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VdrP48281 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VdrP48281 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VdrP48281 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VdrP48281 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VdrP48281 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VdrP48281 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VdrP48281 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VdrP48281 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VdrP48281 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VdrP48281 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VdrP48281 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VdrP48281 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VdrP48281 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VdrP48281 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VdrP48281 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VdrP48281 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VdrP48281 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VdrP48281 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VdrP48281 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VdrP48281 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VdrP48281 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VdrP48281 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VdrP48281 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VdrP48281 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VdrP48281 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VdrP48281 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms