Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms