Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tlx1P43345 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms