Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

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Length 429 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Elk1P41969 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elk1P41969 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elk1P41969 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Elk1P41969 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms