Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a1P41438 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc19a1P41438 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms