Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab17P35292 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab17P35292 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab17P35292 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab17P35292 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab17P35292 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms