Protein–RNA interactions for Protein: P32115

Pax4, Paired box protein Pax-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax4P32115 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax4P32115 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax4P32115 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax4P32115 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax4P32115 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax4P32115 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax4P32115 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax4P32115 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax4P32115 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax4P32115 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms