Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Notch4P31695 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Notch4P31695 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Notch4P31695 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Notch4P31695 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms