Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc10P31257 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc10P31257 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms