Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mmp3P28862 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mmp3P28862 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms