Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxd10P28359 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd10P28359 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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