Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms