Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb9P28076 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb9P28076 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms