Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3P27659 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms