Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmo2P25801 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms