Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd247P24161 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd247P24161 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms