Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gria1P23818 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms